企业的自然人税收管理系统扣缴客户端，会收到税务局推送的员工专项扣除提交信息，成功与否都会有提示。
具体流程如下：
1、进入个税手机APP，点击我要查询；
2、页面跳转，点击扣除信息查询；
3、进入信息查询界面，点击年份；
4、选择申报的年份，点击确定；
5、点击相应的扣除申报信息；
6、年度和扣缴义务人申报有信息并都正确后即申报成功。
专项扣除是否成功，会收到专项扣缴的提示信息，来确定专项扣除是否成功。一般审核期为3-5个工作日，没提示即代表专项扣除已成功。企业自然人，税收管理系统扣缴客户端，会收到税务局推送的员工专项扣缴提示。
法律依据：
《中华人民共和国税收征收管理法》
第一条 为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条 凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行;法律授权规定的，依照制定的行规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行规相抵触的决定。
第四条 法律、行规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
法律、行规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。