厂房租金收入减成本、费用、税收（以上列举的几种税）后有利润，公司出租厂房一般要交纳以下几种税：
1、按照租金收入交纳5%的营业税；
2、按照租金收入交纳12%的房地产税（如果税务部门已经按照地产余值征收1、2%的地产税那么就不再按照租金收入交纳12%的地产税）；
3、按照厂房出租合同所记载的租金的金额交纳千分之一的印花税；
4、厂房租赁如果是主营业务，还应按照33%的税率交纳公司所得税；如果厂房租赁不是主营业务，减除成本、费用、税金后的利润记入其他业务利润，按照33%的税率交纳公司所得税（如果年利润没有达到10万元以上，所得税税率为27%）。
5、在签订租赁合同时，经双方协商，既可由承包经营方交，也可由发包方交。